孙冬茹

发布时间:2020-06-22  作者:  点击量:

 

 

孙冬茹 博士

助理研究员

 

研究领域:

计算化学

生物大分子的分子动力学模拟

生物酶催化反应机理的研究



个人简介:

1990年12月生于黑龙江巴彦,2018年12月于吉林大学理论化学研究所获得物理化学博士学位,在读期间主要从事生物大分子的分子动力学模拟,以及生物酶催化反应机理的研究工作。2019年1月入职于宁波大学新药技术研究院,负责高性能计算平台的搭建及理论计算研究工作。先后在Front. Chem , J Biomol Struct Dyn, , J Mol Recognit, Dalton. T期刊上发表学术论文6篇,主持浙江省自然科学基金1项,参与国家自然科学基金面上项目2项、主持国家重点实验室开放课题1项。


教育与科研经历:

2009.09-2013.07

牡丹江师范学院,化学,学士

2013.09-2018.12

吉林大学,物理化学,博士


2018.12-至今

宁波大学新药技术研究院,助理研究员


科研项目:

浙江省自然科学基金委员会,青年基金项目, LQ20B030004, 前列环素合成酶PGIS催化机理及动力学的理论研究, 2020-01至2022-12, 9万元, 在研, 主持。

分子反应动力学国家重点实验室开放课题“与心血管疾病相关的P450同工酶代谢机理和动力学的理论研究”SKLMRD-K202005,2020-01至2020-12,5万元,在研,主持。


代表性论文:

 D. R. Sun*, X. L. Chen, L. P. Gao, Y. F. Zhao, Y. Wang*. Theoretical Study on the Structural-Function Relationship of Manganese(III)-iodosylarene Adducts, Front. Chem. 2020. doi: 10.3389/fchem.2020.00744

D. R. Sun, Z. J. Wang, Q. C. Zheng*, H. X. Zhang. Exploring the inhibition mechanism on HIF-2 by inhibitor PT2399 and 0X3 using molecular dynamics simulations, .J. Mol. Recognit, 2018, 31(10): e2730.

D. R. Sun, Q. C. Zheng*, H. X. Zhang. Molecular dynamics investigation of stereoselective inhibition mechanism of HIF-2/ARNT heterodimer, J. Mol. Recognit, 2018, 31(1): e2675.

D. R. Sun, Q. C. Zheng*, H. X. Zhang. Probing the interaction mechanism of small molecule inhibitors with matriptase based on molecular dynamics simulation and free energy calculations, J. Biomol. Struct. Dyn, 2017, 35(4): 755-764.

Z. Fu, L .L. Yang, D. R. Sun, Z. X. Qu, Y. F. Zhao, J. L. Gao*, Y. Wang*, Coupled Electron and Proton Transfer in the Piperidine Drug Metabolism Pathway by the Active Species of Cytochromes P450. Dalton. T, 2020 doi:10.1039/C9DT03056E

M. N. Jiang#, X. P. Zhou#; D. R. Sun, H. Gao. Q. C. Zheng, H. X. Zhang, D. Liang*. 2D-QSAR study, molecular docking, and molecular dynamics simulation studies of interaction mechanism between inhibitors and transforming growth factor-beta receptor I (ALK5), J. Biomol. Struct. Dyn, 2018, 36(14): 3705-3717. 

 



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